Amaç: Fibroblast büyüme faktörü reseptörleri (FGFR) 4 farklı alt tipten oluşur (FGFR1-4). Ürotelyal kanser hastalarında FGFR 2 ve 3 alterasyonları (mutasyon veya füzyon) diğerlerine göre daha sık görülür. Bu alterasyonlar FGFR sinyalizasyonuna neden olup karsinogenezise katkıda bulunabilirler ve ayrıca hedefleyici tedaviler için hedef durumundadırlar. Biz bu çalışmada kasa invaze mesane kanserli hastalarda FGFR 1/2/3 mutasyon sıklığını değerlendirmeyi amaçladık.
Yöntem: Kasa invaze mesane kanseri olan 200 hastanın kanser dokularına ait formalinle sabitlenmiş ve parafine gömülmüş bloklardan (FFPE) uygun ticari kitler kullanılarak DNA izolasyonu gerçekleştirildi. DNA parçaları amplifikasyonu yapıldı. Bu aşamada dizilemeyi hedeflediğimiz genler olan FGFR1, FGFR2 ve FGFR3`e yönelik problar ortama eklenerek hibridizasyonun gerçekleşmesi sağlandı. Hedefe yönelik problar sayesinde elde ettiğimiz gen havuzumuz amplifiye edilerek Yeni Nesil Dizileme (NGS) tabanlı sekanslama yöntemi ile dizilendi. Elde edilen veriler Biyoinformatik programlarla değerlendirilerek, American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) kılavuzuna göre sınıflandırıldı.
Bulgular: 200 hastanın 30`unda (%15) FGFR 3` de tier 1(patojenik) varyant saptandı. Bu hastaların 7`sinde kromozom 4 ekzon 6`da kodon 742 arg248cys, 20`sinde ekzon 6`da kodon 746 ser249cys, 2`sinde ekzon 8`de tyr373cys, 1`inde ekzon 8 de gly370cys missense mutasyonu saptandı. 32(%16) hastada FGFR 1/2/3` de tier 2 (muhtemel patojenik) varyant, 79(%39,5) hastada FGFR1/2/3` de tier 3 (önemi bilinmeyen) varyant saptandı. FGFR 1/2` de kanıt düzeyi tier 1 patojenik varyant saptanmadı.
Sonuç: Kasa invaze mesane kanserli hasta kohortumuzun %15`inde FGFR 3`te patojenik varyant saptanmıştır ve bu oran literatürdeki farklı ülkelerde yapılan hasta popülasyonları ile benzerlik göstermektedir. Patojenik mutasyonlar kromozom 4 ekzon 6`da hot spot bölgelerde yoğunlaşmıştır. Bu mutasyonlar kasa invaze mesane kanserinde karsinogeneziste rol oynamaktadır ve FGFR 1-4 inhibitörleri için potansiyel hedefler olarak kabul edilmektedir.